Kesehatan merupakan hak mendasar yang dimiliki oleh setiap warga Negara yang berada di Indonesia dan setiap lapisan masyarakat memiliki hak yang sama dalam menerima pelayanan kesehatan. Upaya pelayanan kesehatan yang dilakukan pemerintah kepada masyarakat tidak lepas dari peran puskesmas. Puskesmas Kabila merupakan salah satu pusat pelayanan kesehatan masyarakat yang ada di Kabupaten Bone Bolango, Kecamatan Kabila. Banyaknya pasien dan jenis penyakit yang berada di masyarakat membuat pihak Puskesmas Kabila kesulitan menentukan penyakit apa yang dominan di wilayah kerjanya tersebut mengingat wilayah kerjanya yang cukup luas yang mencakup 5 kelurahan. Masalah tersebut bisa berdampak pada kesehatan masyarakat itu sendiri karena beberapa jenis penyakit bisa di kategorikan sebagai penyakit berbahaya dan bisa menular. Berdasarkan hal tersebut dibutuhkan sebuah sistem yang bisa mengklasifikasikan penyakit di suatu wilayah yang nantinya dapat membantu pihak Puskesmas Kabila dalam melakukan penyuluhan penyakit agar lebih maksimal dan tepat sasaran. Beberapa parameter yang digunakan berupa Jenis Kelamin, Umur, Status, Pekerjaan, Wilayah, dan Nama Penyakit. Metode KNN dipilih karena dapat mengetahui penerapan metode KNN dalam Membangun sistem klasifikasi penyakit berdasarkan wilayah dengan mendapatkan hasil Akurasi sebesar 80% Recall 100% Precision 62,50% untuk nilai k=3. Hasil akurasi tersebut dapat dikategorikan bahwa aplikasi yang dibuat layak untuk digunakan dalam klasifikasi penyakit berdasarkan wilayah.