Gigi dan mulut menjadi salah satu organ vital yang perlu diutamakan pemeliharaannya. Kasus penyakit gigi dan mulut yang ada di Puskesmas Tilamuta pada tahun 2018 tercatat sebanyak 292 pasien dan pada tahun 2019 tercatat sebanyak 902 pasien, hal ini bisa terjadi karena masyarakat yang cenderung menganggap remeh akan bahaya dari penyakit ini. System pakar merupakan suatu system yang berusaha mengadopsi pengetahuan manusia ke komputer agar komputer dapat menyelesaikan masalah seperti yang dilakukan oleh pakar. Adanya system pakar dapat membantu mendiagnosa jenis penyakit yang berbasis pada pengetahuan yang didapat dari seorang pakar. Penelitian ini menggunakan metode Certainty Factor sebagai salah satu alternative penggunaan system pakar untuk membantu mendiagnosa gejala awal penyakit gigi dan mulut. Metode Certainty Factor digunakan dalam penelitian ini karena metode ini dapat memberikan hasil yang akurat yang didapatkan dari perhitungan berdasarkan bobot gejala yang dipilih. Hal ini dilihat dari hasil penelitian bahwa implementasi Metode Certainty Factor Untuk Diagnosa penyakit Gigi dan Mulut yang direkayasa dapat digunakan untuk mendiagnosa jenis penyakit Gigi dan Mulut. yang dibuktikan dengan hasil pengujian yang dilakukan dengan metode White Box Tesing dan Basis Path yang menghasilkan nilai V(G) = 3 CC, serta pengujian Black Box yang menggambarkan kebenaran sebuah logika sehingga didapat bahwa logika flowchart benar dan menghasilkan Aplikasi diagnosa penyakit Gigi dan Mulut yang tepat dan dapat digunakan.