Terwujudnya akuntabilitas Pengelolaan Keuangan Desa tidak terlepas dari adanya Penerapan Sistem Keuangan Desa dan pengawasan BPD. Tujuan tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui dan menganalisis Pengaruh Sistem Keuangan Desa dan Kualitas Pengawasan BPD Dalam Pengelolaan Keuangan Desa di Desa Botubilotahu Kecamatan Marisa Kabupaten Pohuwato. Dari hasil olahan data, dengan menggunakan SPSS-16 dapat diperoleh nilai thitung sebesar 2,152 lebih besar jika dibandingkan dengan nilai ttabel sebesar 2,052. Artinya bahwa variabel penerapan siskeudes (b1) berpengaruh positif dan signifikan terhadap pengelolaan keuangan desa di Desa Botubilotahu Kecamatan Marisa Kabupaten Pohuwato. Demikian pula halnya diperoleh nilai signifikansi sebesar 0,041 yang lebih kecil dari taraf signifikan yang digunakan yaitu 0,05 atau 5% (0,041 < 0,05). Sedangkan variabel diperoleh nilai thitung sebesar 2,139 lebih besar jika dibandingkan dengan nilai ttabel sebesar 2,052. Yang berarti bahwa variabel pengawasan BPD (b2) berpengaruh positif dan signifikan terhadap pengelolaan keuangan desa di Desa Botubilotahu Kecamatan Marisa Kabupaten Pohuwato. Demikian pula halnya diperoleh nilai signifikansi sebesar 0,042 yang lebih besar dari taraf signifikan yang digunakan yaitu 0,05 atau 5% (0,042 < 0,05). Untuk uji F diperoleh F hitung sebesar 6,460 > Ftabel sebesar 3,35 pada taraf signifikan sebesar 0,005>0,05, berarti Ho ditolak dan Ha diterima yang artinya hubungan antara penerapan siskeudes (b1), pengawasan BPD (b2) terhadap pengelolaan keuangan desa di Desa Botubilotahu Kecamatan Marisa Kabupaten Pohuwato sebesar 6,460 adalah signifikan.