Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan dan menganalisis pengaruh sistem pengendalian intern di MA Al-Ihsaan secara parsial dan mendeskrripsikan dan menganalisis pengaruh sistem pengendalian intern di MA Al-Ihsaan Patilanggio secara simultan. Akumulasi data pokok yaitu melalui kuisoner yang diuji melalui uji validitas dan uji reliabilitas. Penelitian ini dilaksanakan di MA Al-Ihsaan Patilanggio Responden dalam penelitian ini berjumlah 60 orang terdiri dari Yayasan, Kepala sekolah, guru, komite, bendahara, siswa, dan orang tua siswa. Dalam penelitian ini menggunakan metode analisis data Regresi Berganda. Hasil hipotesis pertama menunjukkan bahwa Sistem Pengendalian Intern secara parsial yang terdiri dari lingkungan pengendalian ( X1 ) menunjukkan pengaruh positif, tetapi tidak signifikan terhadap pengelolaan dana Bantuan Operasional Sekolah (Y). Informasi dan komunikasi (X2) menunjukkan pengaruh negatif dan signifikan terhadap pengelolaan dana Bantuan Operasional Sekolah (Y). Pemantauan (X3) menunjukkan pengaruh positif dan signifikan terhadap pengelolaan dana Bantuan Operasional Sekolah (Y). Hasil hipotesis kedua menunjukkan bahwa variabel lingkungan pengendalian(X1), informasi dan komunikasi (X2), dan pemantauan (X3) secara simultan berpengaruh positif dan signifikan terhadap pengelolaan dana Bantuan Operasional Sekolah (Y) di MA Al-Ihsaan Patilanggio sebesar 0, 310 atau 31%. Nilai sebesar 69% dipengaruhi oleh faktor-faktor lain yang tidak masuk kedalam penelitian.